AMBIENTUM BIOETHICA BIOLOGIA CHEMIA DIGITALIA DRAMATICA EDUCATIO ARTIS GYMNAST. ENGINEERING EPHEMERIDES EUROPAEA GEOGRAPHIA GEOLOGIA HISTORIA HISTORIA ARTIUM INFORMATICA IURISPRUDENTIA MATHEMATICA MUSICA NEGOTIA OECONOMICA PHILOLOGIA PHILOSOPHIA PHYSICA POLITICA PSYCHOLOGIA-PAEDAGOGIA SOCIOLOGIA THEOLOGIA CATHOLICA THEOLOGIA CATHOLICA LATIN THEOLOGIA GR.-CATH. VARAD THEOLOGIA ORTHODOXA THEOLOGIA REF. TRANSYLVAN
|
|||||||
Rezumat articol ediţie STUDIA UNIVERSITATIS BABEŞ-BOLYAI În partea de jos este prezentat rezumatul articolului selectat. Pentru revenire la cuprinsul ediţiei din care face parte acest articol, se accesează linkul din titlu. Pentru vizualizarea tuturor articolelor din arhivă la care este autor/coautor unul din autorii de mai jos, se accesează linkul din numele autorului. |
|||||||
STUDIA CHEMIA - Ediţia nr.2 (Tom I din 2010 | |||||||
Articol: |
ZINC-CONTAINING ACTIVE SITE IN A PARTIALLY MODIFIED 1GKM CRYSTAL STRUCTURE OF HISTIDINE AMMONIA-LYASE: A COMPUTATIONAL INVESTIGATION. Autori: AMALIA-LAURA SEFF, SAROLTA PILBÁK, IOAN SILAGHI-DUMITRESCU, LÁSZLÓ POPPE. |
||||||
Rezumat: The histidine ammonia-lyase (HAL) biocatalyst has an important role in the formation of (E)-urocanic acid from L-histidine eliminating ammonia. In order to investigate the active center of HAL, we have prepared “in silico” a HAL model with a compact active center on the basis of the recently appeared phenylalanine ammonia-lyase (PAL) structure (PDB code: 3CZO). Furthermore, to have a better view on the orientation of a key reaction intermediate within the active site, systematic conformational analysis has been performed. Furthermore, the possible positions of the L-histidine/(E)-urocanic acid were evaluated by optimization and docking.
Keywords: histidine ammonia-lyase, homology modeling, conformational analysis, docking, Zn2+ |
|||||||